近日，省农科院畜牧兽医研究所动物分子育种研究团队在科学数据共享的国际专业期刊《Scientific Data》（中科院二区，5-year IF=8.7）上发表了题为“De novo genome assembly of Yanbian cattle using PacBio HiFi and Hi-C combined with RNA-seq data”的研究论文。省农科院方文文研究实习员和曹阳副研究员（女）为论文的共同第一作者，曹阳研究员和赵玉民研究员为共同通讯作者。

延边牛作为中国五大地方良种黄牛之一，广泛分布于我省东部地区，经过几个世纪的自然和人工选择，具有很强的抗逆性和抗寒性。虽已有关于延边牛适应性的相关候选基因的诸多研究，但都是基于海福特牛参考基因组，缺少延边牛特异的基因组信息。因此，组装一个高质量的延边牛基因组是挖掘其特异遗传信息、解析适应性机制的关键途径。该研究基于HiFi、Hi-C和RNA-seq数据组装了高质量的延边牛基因组一套，基因组总长度达2.8Gb，Contig N50为86.41Mb，Scaffold N50达111.08Mb，注释了基因组中51.94%的重复序列及20,421个蛋白编码基因。二代重测序数据平均比对率达99.56%，验证了碱基水平的准确性。此外，93%的完整BUSCOs也验证了该基因组的完整性。该研究为延边牛进化选择和遗传特征解析提供了关键遗传基础，也为地方品种保护提供了宝贵资源。

该研究得到了吉林省农业科技创新工程、国家肉牛牦牛产业技术体系、农业农村部肉牛遗传育种重点实验室等项目的支持。

论文链接：https://www.nature.com/articles/s41597-025-05689-z

（畜牧兽医研究所 方文文）
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初审：张立春 复审：杜 鹃 终审：刘文国