国际合作处是“中心”国际合作的职能部门。主要职责是：
1、归口管理“中心”与国外各单位的农业合作与交流，指导、协调和管理涉外事务。宣传贯彻国家涉外的方针、政策，拟订涉外规章制度，并组织贯彻落实；编制实施“中心”对外合作与交流计划。
2、负责组织选派人员出国（境）考察、进修、培训、攻读学位、合作研究、参加国际会议等，并负责审核、报批工作，以及出国后的管理及回国后的有关工作。
3、负责组织来华团组的接待工作。
4、负责“中心”农业国际交流与合作，各类国际合作项目的申报、立项、组织、实施及管理；以及组织申报和实施技术、智力、资源引进及外资项目的争取工作。
5、负责“中心”国外名誉研究员的聘请和管理工作。
6、主办、承办国际学术会议。
7、负责收集国际农业科技信息，研究世界农业科技、生产动态，并对“中心”开展国际合作与交流提出对策和建议。
8、办理“中心”领导交办的其它工作。